本文標題："菌群中鑒別微生物-培養(yǎng)的細胞檢測顯微鏡"
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菌群中鑒別微生物-培養(yǎng)的細胞檢測顯微鏡
被鑒定為屬于未培養(yǎng)的古生菌，如ANME一2。這些菌周圍是硫酸鹽
還原菌群。這些工作為生物代謝中甲烷氧化提供了有力證據(jù)。雖然13c
標記參與甲烷氧化是可以斷定的并且靠SIMS分析已經(jīng)得到解釋，但不利
用加入標記的培養(yǎng)基其他形式的C代謝可能更難說明。利用熒光標記的
寡核苷酸探針來研究細胞固定或雜交需要考慮外加碳源的同位素干擾。
單細胞同位素標記技術主要局限是它們只能提供可標記或可同位素
示蹤的培養(yǎng)基代謝信息。這不利于我們對整個單細胞代謝過程的描繪。
對于這個結果，兩種新的基于PCR的方法已經(jīng)得到發(fā)展，保證了復雜環(huán)
境樣本中單細胞基因內含物的分離。第一個技術是末端微流數(shù)字PCR配
合16S rDNA鑒定單個未被培養(yǎng)的細胞，并同時檢測這些細胞中的其他基
因。利用微流設備從復雜混合物中稀釋并分離細胞。這個分離步驟很關
鍵，分離出的細胞將分別作為多重復PCR反應的模版。雖然到目前為止
，這項技術只被用于將研究特定代謝基因與木養(yǎng)白蟻后腸中一種細菌的
聯(lián)系，但原則上，它能夠應用于任何基因與16S rDNA已鑒定的單細胞之
間。這項技術能分開獨立應用于不同時期的細胞(在成熟，基因表達或
基因定位)研究中。而且，單細胞PCR的應用避免了PCR人為誤差，例如
擴增誤差和非設計性產物等。隨著白蟻后腸的研究，相似的微流技術已
用于人類牙齦縫隙中分離的微生物。在這項工作中，基因組從目標個體
細胞擴增，保證了它的基因擴增大于1000。隨著單細胞基因組序列方法
的發(fā)展，未來會有更好的基因組技術出現(xiàn)。這項研究的有利之處在于它
能在復雜的菌群中鑒別出催化目標反應的微生物(例如，檢測特定功能
基因的出現(xiàn))。在這方面它與同位素陣列或SIP相似，對于微流數(shù)字PCR
技術細胞作為區(qū)別實體信息被保存。
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